GCG (Wisconsin Package)中文使用說明
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軟體名稱: GCG (Wisconsin Package) |
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最新版本: 10.3 (# '02-5) |
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GCG 新手使用文件 (Wisconsin Package Online User's Guide) |
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簡 介： |
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國 家 衛 生 研 究 院 資 訊 組 於 八 十 六 年 七 月 份 開 始 ， 安 裝 巨 分 子 序 列 資 料 庫 檢 索 及 分 析軟 體 Wisconsin Package 9.1 版 (GCG,Inc)， 於 本 院 的 工 作 站 上 (bioinfo.nhri.org.tw), 並 於 九 月 份 開 始 對 外 提 供 服 務。 GCG 所 含 括 的 生 物 分 子 序 列 資 料 庫 約 2 個 月 總 更 新 乙 次， 本 院 並 計 畫 對 各 項 資 料 庫 提 供 daily ftp 的 功 能。
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使 用 模 式： |
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Wisconsin Package 安 裝 於 工 作 站 上， 在 用 Unix 作 業 系 統 下 使 用， 目 前 提 供 三 種 連 線 的 使 用 方 式：
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GCG 文 字 指 令 模 式：允 許 使 用 者 直 接 透 過 網 路 線，以 直 接 輸 入 GCG commands 的 方 式 使 用。 |
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X 視 窗 圖 形 介 面 模 式：允 許 使 用 者 透 過 工 作 站， 個 人 電 腦 或 Mac 電 腦 上 執 行 模 擬 終 端 機 的 程 式 連 線，以 Xwindow 的 圖 形 介 面 使 用。 |
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Web Interface 界 面：允 許 使 用 者 透 過 瀏 覽 器 的 方 式 進 行 連 線，透 過 Web 的 呈 現 方 式，在 使 用 操 作 與 存 取 檔 案 上 更 為 便 利。Wisconsin Package 的 Web interface 其 實 就 是 SeqWeb |
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連 線 程 序： |
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GCG 文 字 指 令 模 式： |
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> telnet://bioinfo.nhri.org.tw
> login: xxxxxx (please enter your user name)
> password: yyyyyy (please enter your password)
> 鍵入程式名稱，進行分析工作 |
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X 視 窗 圖 形 介 面 模 式： |
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> telnet://bioinfo.nhri.org.tw
> login: xxxxxx (please enter your user name)
> password: yyyyyy (please enter your password)
> setenv DISPLAY xxx.xxx.xxx.xxx:0.0(your local IP)
> seqlab |
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| 註1 |
xxxxxx 為 在 bioinfo.nhri.org.tw 上 的 帳 號，yyyyyy 為 帳 號 的 密 碼。 |
| 註2 |
使 用 X 視 窗 模 式 時，在 執 行 telnet 連 接 bioinfo.nhri.org.tw 之 前， 應 先 執 行xhost + 的 指 令。 |
| 註3 |
使 用 者 應 先 安 裝 X 視 窗 程 式，如 Xwin32 等。 |
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如 何 於 GCG Command Mode 存 放 檔 案？ |
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必 須 利 用 ftp 軟 體 ( 請 見 常 用 軟 體 下 載 ) 上 傳 或 下 載 存 放 於 自 己 電 腦 或 GCG Server 中 的 序 列 檔 案，如 圖 所 示。 |
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此 外，使 用 者 必 須 注 意 序 列 檔 案 ( 通 常 為 純 文 字 格 式，多 設 為 .txt, .seq, .pep, .dat, .fasta, .list, .msf, pretty...... 等 附 檔 名 ) 以 及 postscript (如 .ps)的 檔 案， 必 須 以 ascii 模 式 上 傳 和 下 載，若 是 圖 片 類 (如 .gif ) 檔 案，則 必 須 以 binary 模 式 上 傳 及 下 載。 |
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GCG 諮 詢 專 線 |
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電 話：(03720616666
ext 33629 汪 詩 海 先 生 |
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e-mail ：bioinfo@nhri.org.tw |
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Fax：(02) 8792-4751 |
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住址：國 家 衛 生 研 究 院 資 訊 組，台 北 市 內 湖 區 民 權 東 路 六 段 109 號 3 樓。 |
