TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 教 育 課 程
JEMBOSS 基 礎 課 程
主辦單位: |
國家衛生研究院 基因體醫學國家型科技計畫 |
簡 介
TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 為 基 因 體 醫 學 國 家 型 科 技 計 畫 所 支 持 ,由 國 家 衛 生 研 究 院 研 究 資 源 處 執 行 , 以 提 供 並 推 廣 各 項 生 物 資 訊 服 務 為 宗 旨 。 為 普 及 JEMBOSS 分 析 工 具 的 使 用 , 本 計 畫 特 開 設 JEMBOSS 基 礎 課 程 。 JEMBOSS 全 名 為 Java-EMBOSS,即 Java 介 面 的 EMBOSS 程 式 圖 形 使 用 介 面 , 為 英 國 的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所 開 發 並 持 續 維 護 更 新 , 採 用 user-friendly 的 Java 視 窗 執 行 EMBOSS 程 式 , 並 加 入 檔 案 管 理 功 能 , 使 用 者 download Java we start 執 行 程 式 後 , 即 可 在 自 己 的 PC 操 作 JEMBOSS 並 儲 存 分 析 結 果 , 使 用 方 便 。 本 課 程 將 介 紹 網 路 資 源 、 常 用 JEMBOSS 軟 體 之 原 理 和 使 用 方 法 介 紹 , 並 提 供 電 腦 實 作 , 讓 使 用 者 能 更 在 課 程 結 束 後 順 利 使 用 JEMBOSS 進 行 序 列 分 析 的 工 作 。 本 課 程 為 最 基 礎 之 課 程 , 適 合 初 學 序 列 分 析 者 。[ 國衛院生物資訊服務 ] [ EMBOSS服務簡介 ] 課 程
內 容:JEMBOSS 程式介紹與電腦操作。
時 間:九十三年 五月二十七、二十八日 (週四全天、週五上午,計一天半)
地 點: 中 研 院 生 圖 電 腦 教 室
北 市 研 究 院 路 二 段 128 號 [地圖]上課人數: 每場 50人
報 名 費 : 免 費 。
講 員 :國家衛生研究院 資訊組 李桂玉、汪詩海、翁翊嵐
時 間 課 程 內 容93年 05月27日 (週四)
09:30 - 16:30
- EMBOSS系統簡介
- 序列資料庫及程式基本操作
- 以文字搜尋資料庫程式操作練習
- BLAST基本概念及程式操作練習
- 雙序列並列比對分析
- 多序列並列比對分析
- 多序列並列比對分析程式練習
93年 05月28日 (週五)
09:30 - 12:00
- EMBOSS GUI程式操作練習
- Remap, Getorf 程式練習
- Unix系統及Command mode EMBOSS 簡介
課 程 注 意 事 項
- 本 課 程 以 E-mail 發 給 學 員 上 課 通 知,報 名 資 格 請 勿 轉 讓 或 代 理 參 加。
- 上 課 時 請 攜 帶 有 效 的 使 用 帳 號 (username 及 password) 上 機 操 作,並 請 於 上 課 前 先 login,測 試 是 否 有 任 何 問 題。 持 有 本 院 GCG 帳 號 即 可 使 用 JEMBOSS,毋 需 重 新 申 請。若 無 帳 號 可 由 實 驗 室 主 持 人 提 出 帳 號 申 請 。
- 敬 請 準 時 報 到 , 以 避 免 影 響 課 程 之 進 行。
- 上 課 時 可 帶 一 些 DNA 序 列 做 為 練 習 之 用 , 請 以 純 文 字 檔 存 在 3.5 吋 磁 碟 片 中 , 長度 請 勿 超 過 1kb 。
- 上 課 時 請 勿 攜 帶 太 多 物 品 , 並 請 遵 守 上 課 場 所 的 相 關 規 定 。
- 本 課 程 恕 不 供 應 午 餐 。
課 程 學 員 錄 取 名 單
姓 名 |
單 位 |
職 稱 |
上官永惠 |
國防醫學院預醫所 |
研究員 |
王沛文 |
國衛院 |
研究助理 |
王芸馨 |
台灣大學 |
助理 |
王姿惠 |
疾病管制局 |
研究助理 |
任冠樺 |
台北醫學大學 |
研究助理 |
余俊欣 |
水產試驗所 |
助理研究員 |
吳芳姿 |
疾病管制局 |
助理研究員 |
李幸禧 |
陽明大學 |
研究生 |
李桂芳 |
慈濟醫院 |
技術員 |
林念修 |
陽明大學 |
研究助理 |
林書葦 |
陽明大學 |
碩二學生 |
林智暉 |
疾病管制局 |
研究員 |
花仲涇 |
基隆長庚醫院 |
主治醫師 |
侯嘉隆 |
工研院生醫中心 |
研究員 |
姚秋如 |
台灣大學 |
博士班研究生 |
施養信 |
中興大學 |
助理教授 |
施錫璋 |
生物技術開發中心 |
助理 |
洪永昌 |
台灣大學 |
研究生 |
胡忠怡 |
台灣大學 |
助理教授 |
徐敏智 |
疾病管制局 |
研究助理 |
徐毓蘭 |
生物技術開發中心 |
研究員 |
高怡婷 |
藥檢局 |
薦任技士 |
張良慈 |
基隆長庚醫院 |
主治醫師 |
莊朝鈞 |
國家高速電腦中心 |
研究助理 |
陳永成 |
疾病管制局 |
研究助理 |
陳燕萍 |
家畜衛生試驗所 |
助理研究員 |
陳曜鴻 |
淡江大學 |
助理教授 |
陳麗璇 |
家畜衛生試驗所 |
助理研究員 |
曾繼鋒 |
交通大學 |
博士班研究生 |
游宗霖 |
生物技術開發中心 |
助理研究員 |
黃玉文 |
馬偕紀念醫院 |
助研究員 |
黃百綱 |
工研院生醫中心 |
工程師 |
黃家富 |
水產試驗所 |
助理研究員 |
黃偉瀚 |
中央研究院 |
研究助理 |
裘文馥 |
台灣師範大學 |
研究生 |
詹芳瑜 |
台大醫院 |
研究助理 |
廖美惠 |
疾病管制局 |
技士 |
劉玉彬 |
家畜衛生試驗所 |
助理研究員 |
蔡志東 |
動物所 |
研究生 |
蔡宗義 |
交通大學 |
碩士班 |
蔡芳媚 |
家畜衛生試驗所 |
助理研究員 |
鄭永祥 |
宜蘭大學 |
教授 |
謝孝正 |
中央大學 |
碩士生 |
謝瑞煒 |
疾病管制局 |
薦任技士 |
簡君如 |
台灣師範大學 |
研究生 |
林于勤 |
疾病管制局 |
計畫助理 |
吳啟智 |
中央研究院 |
研究助理 |
陳夙怡 |
中央研究院 |
學生 |
劉雅沁 |
中央研究院 |
學生 |
陳國緯 |
疾病管制局 |
研究助理 |
羅珮華 |
台灣大學 |
研究助理 |
洽 詢 方 式
- 李桂玉 女士
- 國家衛生研究院 資訊組
- 電話:(03720616666 轉 33615
- 傳真:(02) 8792-4751
- E-mail:bioinfo@nhri.org.tw
- 地址:台北市內湖區民權東路六段109號三樓
Last updated 2004/05/24