TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 教 育 課 程

JEMBOSS 基 礎 課 程

 

主辦單位
國家衛生研究院
基因體醫學國家型科技計畫

學員錄取名單

blueball 簡   介

TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 為 基 因 體 醫 學 國 家 型 科 技 計 畫 所 支 持 ,由 國 家 衛 生 研 究 院 研 究 資 源 處 執 行 , 以 提 供 並 推 廣 各 項 生 物 資 訊 服 務 為 宗 旨 。 為 普 及 JEMBOSS 分 析 工 具 的 使 用 , 本 計 畫 特 開 設 JEMBOSS 基 礎 課 程 。 JEMBOSS 全 名 為 Java-EMBOSS,即 Java 介 面 的 EMBOSS 程 式 圖 形 使 用 介 面 , 為 英 國 的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所 開 發 並 持 續 維 護 更 新 , 採 用 user-friendly 的 Java 視 窗 執 行 EMBOSS 程 式 , 並 加 入 檔 案 管 理 功 能 , 使 用 者 download Java we start 執 行 程 式 後 , 即 可 在 自 己 的 PC 操 作 JEMBOSS 並 儲 存 分 析 結 果 , 使 用 方 便 。 本 課 程 將 介 紹 網 路 資 源 、 常 用 JEMBOSS 軟 體 之 原 理 和 使 用 方 法 介 紹 , 並 提 供 電 腦 實 作 , 讓 使 用 者 能 更 在 課 程 結 束 後 順 利 使 用 JEMBOSS 進 行 序 列 分 析 的 工 作 。 本 課 程 為 最 基 礎 之 課 程 , 適 合 初 學 序 列 分 析 者

[ 國衛院生物資訊服務 ]  [ EMBOSS服務簡介 ]  

blueball 課 程

內 容:JEMBOSS 程式介紹與電腦操作。

時 間:九十三年 五月二十七、二十八日 (週四全天、週五上午,計一天半)

地 點: 中 研 院 生 圖 電 腦 教 室
     北 市 研 究 院 路 二 段 128 號  
[地圖]

上課人數: 每場 50人

報 名 費 : 免 費

講 員 :國家衛生研究院 資訊組 李桂玉、汪詩海、翁翊嵐
時   間
課 程 內 容

93年 05月27日 (週四)

09:30 - 16:30

  • EMBOSS系統簡介

  • 序列資料庫及程式基本操作

  • 以文字搜尋資料庫程式操作練習

  • BLAST基本概念及程式操作練習

  • 雙序列並列比對分析

  • 多序列並列比對分析

  • 多序列並列比對分析程式練習

93年 05月28日 (週五)

09:30 - 12:00

  • EMBOSS GUI程式操作練習

  • Remap, Getorf 程式練習

  • Unix系統及Command mode EMBOSS 簡介

blueball 課 程 注 意 事 項
  1. 本 課 程 以 E-mail 發 給 學 員 上 課 通 知,報 名 資 格 請 勿 轉 讓 或 代 理 參 加。
  2. 上 課 時 請 攜 帶 有 效 的 使 用 帳 號 (username 及 password) 上 機 操 作,並 請 於 上 課 前 先 login,測 試 是 否 有 任 何 問  題。 持 有 本 院 GCG 帳 號 即 可 使 用 JEMBOSS,毋 需 重 新 申 請。若 無 帳 號 可 由 實 驗 室 主 持 人 提 出 帳 號 申 請

  3. 敬 請 準 時 報 到 , 以 避 免 影 響 課 程 之 進 行。
  4. 上 課 時 可 帶 一 些 DNA 序 列 做 為 練 習 之 用 , 請 以 純 文 字 檔 存 在 3.5  吋 磁 碟 片 中 , 長度 請 勿 超 過 1kb 。

  5. 上 課 時 請 勿 攜 帶 太 多 物 品 , 並 請 遵 守 上 課 場 所 的 相 關 規 定 。

  6. 本 課 程 恕 不 供 應 午 餐 。

blueball 課 程 學 員 錄 取 名 單

姓 名
單  位
職 稱
上官永惠
國防醫學院預醫所
研究員
王沛文
國衛院
研究助理
王芸馨
台灣大學
助理
王姿惠
疾病管制局
研究助理
任冠樺
台北醫學大學
研究助理
余俊欣
水產試驗所
助理研究員
吳芳姿
疾病管制局
助理研究員
李幸禧
陽明大學
研究生
李桂芳
慈濟醫院
技術員
林念修
陽明大學
研究助理
林書葦
陽明大學
碩二學生
林智暉
疾病管制局
研究員
花仲涇
基隆長庚醫院
主治醫師
侯嘉隆
工研院生醫中心
研究員
姚秋如
台灣大學
博士班研究生
施養信
中興大學
助理教授
施錫璋
生物技術開發中心
助理
洪永昌
台灣大學
研究生
胡忠怡
台灣大學
助理教授
徐敏智
疾病管制局
研究助理
徐毓蘭
生物技術開發中心
研究員
高怡婷
藥檢局
薦任技士
張良慈
基隆長庚醫院
主治醫師
莊朝鈞
國家高速電腦中心
研究助理
陳永成
疾病管制局
研究助理
陳燕萍
家畜衛生試驗所
助理研究員
陳曜鴻
淡江大學
助理教授
陳麗璇
家畜衛生試驗所
助理研究員
曾繼鋒
交通大學
博士班研究生
游宗霖
生物技術開發中心
助理研究員
黃玉文
馬偕紀念醫院
助研究員
黃百綱
工研院生醫中心
工程師
黃家富
水產試驗所
助理研究員
黃偉瀚
中央研究院
研究助理
裘文馥
台灣師範大學
研究生
詹芳瑜
台大醫院
研究助理
廖美惠
疾病管制局
技士
劉玉彬
家畜衛生試驗所
助理研究員
蔡志東
動物所
研究生
蔡宗義
交通大學
碩士班
蔡芳媚
家畜衛生試驗所
助理研究員
鄭永祥
宜蘭大學
教授
謝孝正
中央大學
碩士生
謝瑞煒
疾病管制局
薦任技士
簡君如
台灣師範大學
研究生
林于勤
疾病管制局
計畫助理
吳啟智
中央研究院
研究助理
陳夙怡
中央研究院
學生
劉雅沁
中央研究院
學生
陳國緯
疾病管制局
研究助理
羅珮華
台灣大學
研究助理

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Last updated 2004/05/24