TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 教 育 課 程
Phylogenetic Analysis Workshop
分子演化分析研習會
主辦單位: | 國家衛生研究院 |
合辦單位: | 基因體醫學國家型科技計畫 |
課 程 簡 介
TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 為 基 因 體 醫 學 國 家 型 科 技 計 畫 所 支 持 ,由 國 家 衛 生 研 究 院 研 究 資 源 處 執 行 , 以 提 供 並 推 廣 各 項 生 物 資 訊 服 務 為 宗 旨。為 普 及 分 子 演 化 分 析 工 具 之 使 用,本 計 畫 特 開 設 分 子 演 化 分 析 研 習 課 程。
自 基 因 體 定 序 計 畫 陸 續 進 行 後 , 以 不 同 物 種 的 同 一 基 因 序 列 分 析 而 定 出 各 物 種 間 之 演 化 關 係 的 分 子 演 化 分 析 , 越 來 越 受 到 不 同 領 域 的 研 究 人 員 的 重 視 。 這 類 演 化 分 析 除 程 式 的 實 際 操 作 之 外 , 若 能 了 解 其 分 析 理 論 基 礎 , 可 增 加 分 析 結 果 之 正 確 性 及 可 信 度 。
本 課 程 主 要 講 解 分 子 演 化 分 析 基 本 理 論、介 紹 常 用 之 分 子 演 化 分 析 軟 體, 並 配 合 電 腦 上 機 操 作,俾 使 學 員 對 分 子 演 化 分 析 能 有 更 進 一 步 的 了 解 。
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課 程 時 間
時 間: 九十三年 五月十九日 、 二十日 (週三、四) 共 二 日
地 點: 中 研 院 生 圖 電 腦 教 室
北 市 研 究 院 路 二 段 128 號 [地圖]
上課人數: 40 人
課 程 內 容
講 員 : 劉信孚 博士
馬偕紀念醫院 醫學研究科 副研究員
時 間 | 課 程 內 容 |
五月十九日 | |
9:00 - 10:30 |
Introduction to Molecular Evolution and Phylogenetic Analysis Phylogenetic Analysis Methods |
10:45 - 12:00 | Phylogenetic Analysis Methods Distance matrix methods, substitution models |
Lunch break | |
13:30 - 15:00 | Computer Lab Phylip home page, Genedoc (file conversion) Phylogenetic analysis programs (PHYLIP): distance matrix methods |
15:15 - 17:00 | Phylogenetic Analysis Methods Discrete character methods (Parsimony method, Maximum likelihood method) Computer Lab Phylogenetic analysis programs (PHYLIP): discrete character methods |
五月二十日 | |
9:00 - 10:30 |
Statistical test for phylogenetic trees Examples of Applications Using Phylogenetic Analysis |
10:45 - 12:00 | Computer Lab Phylogenetic analysis programs (PHYLIP): discrete character methods bootstrap analysis |
Lunch break | |
13:30 - 16:00 | The Other Phylogenetic Analysis Methods Quartet puzzling method, likelihood mapping analysis, .... etc. Computer Lab Phylogenetic analysis programs: (PUZZLE, Fast-dnaml, MacClade, etc) Free practice and trouble shooting. |
上 課 注 意 事 項
- 報 名 資 格 請 勿 轉 讓 或 代 理 參 加 , 若 無 法 來 上 課 , 請 儘 早 通 知 主 辦 單 位 , 以 便 將 機 會 讓 給 其 他 人 。
- 圖 書 館 於 早 上 8:30 開 館 , 請 於 早 上 8:40-9:00 報 到 , 並 請 準 時 到 場 上 課 。
- 上 課 時 可 帶 align 好 的 多 條 DNA 序 列 做 為 練 習 之 用 , 請 以 純 文 字 檔 存 在 3.5 吋 磁 碟 片 中。
- 上 課 時 請 勿 攜 帶 太 多 物 品 , 並 請 儘 量 將 包 包 放 在 圖 書 館 之 置 物 櫃 中 , 並 遵 守 圖 書 館 相 關 規 定 。
- 本 課 程 恕 不 供 應 午 餐 。
*** 課 程 名 單 ***
05/19、20 分子演化課程
姓 名 |
單 位 |
職 稱 |
王維新 |
工研院生醫中心 |
研究員 |
何孟如 |
交通大學 |
研究助理 |
吳竺燕 |
馬偕醫院 |
研究助理 |
吳芳姿 |
疾病管制局 |
薦任技士 |
吳聲華 |
國立自然科學博物館 |
研究員 |
李元綺 |
台北醫學大學 |
助理教授 |
李冠群 |
中央研究院 |
博士後研究員 |
李瑞花 |
中央研究院 |
博士後研究 |
林世斌 |
國立宜蘭大學 |
副教授 |
林育如 |
中興大學 |
博士班學生 |
林智暉 |
疾病管制局 |
研究員 |
邱淑君 |
疾病管制局 |
研究員 |
侯嘉隆 |
工研院生醫中心 |
研究員 |
施養信 |
中興大學 |
助理教授 |
范志民 |
靜宜大學 |
研究生 |
師健民 |
國防醫學院 |
教授 |
徐秀君 |
國家衛生研究院 |
研究助理 |
徐駿森 |
中央研究院 |
博士後研究員 |
高怡婷 |
衛生署藥檢局 |
薦任技士 |
高偉程 |
中央研院院 |
助理 |
崔道貞 |
台大醫院 |
醫檢師 |
張育彰 |
衛生署藥檢局 |
薦任技士 |
張晉瑋 |
食品所 |
副研究員 |
許秀惠 |
農委會毒物所 |
副研究員 |
許德賢 |
台灣大學 |
博士後研究 |
陳盈臻 |
台灣大學 |
研究助理 |
陳燕萍 |
家畜衛生試驗所 |
助理研究員 |
陳曜鴻 |
淡江大學 |
助理教授 |
陳麗璇 |
家畜衛生試驗所 |
助理研究員 |
隋孟君 |
中央研究院 |
博士後研究 |
黃百綱 |
工研院生醫中心 |
工程師 |
黃詩宜 |
輔仁大學 |
研究生 |
楊怡真 |
衛生署藥檢局 |
薦任技士 |
楊杰穎 |
台灣大學 |
研究生 |
葉昌偉 |
國家高速電腦中心 |
助理研究員 |
廖美惠 |
疾病管制局 |
技士 |
熊耀筠 |
東吳大學 |
研究助理 |
趙麗蓮 |
國防醫學院 |
助教 |
劉名允 |
清華大學 |
博士候選人 |
劉育姍 |
台灣大學 |
博士班研究生 |
蔡芳媚 |
家畜衛生試驗所 |
助理研究員 |
鄧惠瑜 |
清華大學 |
博士班研究生 |
戴榮湘 |
中央研究院 |
Research Fellow |
謝奉家 |
農委會毒物所 |
助理研究員 |
謝俊逸 |
臺中健康暨管理學院 |
助理教授 |
魏育慧 |
食品所 |
副研究員 |
黃柏蒼 |
台灣大學 |
博士 |
洽 詢 方 式
- 李桂玉 女士
- 國家衛生研究院 資訊組
- 電話:(02) 2653-4401 轉 33615
- 傳真:(02) 8792-4751
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Last updated 2004/05/10