TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 教 育 課 程

JEMBOSS 基 礎 課 程

 

主辦單位
國家衛生研究院
國立成功大學生物資訊中心
國科會基因體醫學國家型科技計畫

課程簡介 課程內容 注意事項 學員名單 洽詢方式

blueball 簡   介

TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 為 基 因 體 醫 學 國 家 型 科 技 計 畫 所 支 持 ,由 國 家 衛 生 研 究 院 研 究 資 源 處 執 行 , 以 提 供 並 推 廣 各 項 生 物 資 訊 服 務 為 宗 旨 。 為 普 及 JEMBOSS 分 析 工 具 的 使 用 , 本 計 畫 特 與 國 立 成 功 大 學 生 物 資 訊 中 心 合 作 , 開 設 JEMBOSS 基 礎 課 程 。 JEMBOSS 全 名 為 Java-EMBOSS,即 Java 介 面 的 EMBOSS 程 式 圖 形 使 用 介 面 , 為 英 國 的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所 開 發 並 持 續 維 護 更 新 , 採 用 user-friendly 的 Java 視 窗 執 行 EMBOSS 程 式 , 並 加 入 檔 案 管 理 功 能 , 使 用 者 download Java we start 執 行 程 式 後 , 即 可 在 自 己 的 PC 操 作 JEMBOSS 並 儲 存 分 析 結 果 , 使 用 方 便 。 本 課 程 將 介 紹 網 路 資 源 、 常 用 JEMBOSS 軟 體 之 原 理 和 使 用 方 法 介 紹 , 並 提 供 電 腦 實 作 , 讓 使 用 者 能 更 在 課 程 結 束 後 順 利 使 用 JEMBOSS 進 行 序 列 分 析 的 工 作 。 本 課 程 為 最 基 礎 之 課 程 , 適 合 初 學 序 列 分 析 者

[ 國衛院生物資訊服務 ]  [ EMBOSS服務簡介 ]  

blueball 課 程

內 容:JEMBOSS 程式介紹與電腦操作。共舉辦二場,內容相同,請擇一參加。

時 間:十一月二十六日 (週 三) 第一場
    十一月二十七日 (週 四) 第二場

地 點: 成功大學醫學院圖書館 一樓電腦教室
    (台南市大學路 1號建國校區) [學校位置圖]

上課人數: 每場 70人

報 名 費 : 免 費

講 員 :國家衛生研究院 資訊組 李桂玉女士、翁翊嵐 先生 、汪詩海先生
時   間
內    容
92年11月26日, 27日
(週三、週四)

09:30 - 16:30

  • 課程簡介 (李桂玉)
  • JEMBOSS系統簡介及基本操作 (汪詩海)
  • 安裝 Java Web Start, wossname, seqret 程式練習(汪詩海)
  • 資料庫及EMBOSS程式簡介 wossname, seqret (汪詩海)
  • 以文字搜尋資料庫 Entrez, ExPASy, EBI (李桂玉)
  • 序列比對分析基本概念 (李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介 needle, water, emma, showalign,
     prettyplot (李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介 remap, getorf, plotorf (翁翊嵐)

  • blueball 課 程 注 意 事 項
    1. 本 課 程 以 E-mail 發 給 學 員 上 課 通 知,報 名 資 格 請 勿 轉 讓 或 代 理 參 加。
      本 次 課 程 因 11/26 報 名 人 數 過 多,且 二 場 課 程 內 容 相 同,故 重 複 報 名 11/26, 11/27 兩 場 者,安 排 參 加 11/27 場 次,不 便 之 處,請 見 諒!

    2. 上 課 時 請 攜 帶 有 效 的 使 用 帳 號 (username 及 password) 上 機 操 作,並 請 於 上 課 前 先 login,測 試 是 否 有 任 何 問  題。 持 有 本 院 GCG 帳 號 即 可 使 用 JEMBOSS,毋 需 重 新 申 請。若 無 帳 號 可 由 實 驗 室 主 持 人 提 出 帳 號 申 請

    3. 敬 請 準 時 報 到 , 以 避 免 影 響 課 程 之 進 行。

    4. 上 課 時 可 帶 一 些 DNA 序 列 做 為 練 習 之 用 , 請 以 純 文 字 檔 存 在 3.5  吋 磁 碟 片 中 , 長度 請 勿 超 過 1kb 。

    5. 上 課 時 請 勿 攜 帶 太 多 物 品 , 並 請 遵 守 上 課 場 所 的 相 關 規 定 。

    6. 本 課 程 恕 不 供 應 午 餐 。

    blueball 課 程 名 單

    11/26 JEMBOSS 學員名單

    姓 名
    單  位
    職 稱
    姓 名
    單  位
    職 稱
    尹書翊
    成功大學生科所
    碩士生
    陳盈帆
    成功大學醫學院
    學生
    王泰來
    中山大學
    碩士生
    陳重仁
    義守大學
    助理教授
    王智立
    熱帶園藝試驗所
    助理研究員
    陳韋如
    成功大學
    碩士生
    王雅貞
    成功大學
    學生
    陳健福
    成功大學醫學院
    學生
    王雅惠
    成大醫院
    學生
    陳連進
    成功大學
    博士生
    王嘉蔚
    成功大學
    學生
    陳喬維
    成功大學醫學院
    研究助理
    王慧菁
    成功大學醫學院
    學生
    曾鴻裕
    中山大學
    碩士生
    王瀅嵐
    成功大學
    碩士生
    童聖凱
    成功大學
    學生
    申忠哲
    成功大學
    學生
    馮盈勳
    成功大學醫學院
    學生
    吳漢傑
    國家衛生研究院
    研究助理
    馮維屏
    成功大學醫學院
    碩士生
    呂政哲
    成功大學
    博士班
    黃佰璋
    新樓醫院
    技術員
    李幸慧
    成功大學醫學院
    博士生
    黃建中
    成功大學
    碩士生
    李蕙齡
    成功大學
    碩士生
    黃欽威
    成功大學附設醫院
    醫師
    李儼峰
    家畜疾病防治所
    獸醫師
    黃程斌
    成功大學
    碩士生
    杜秀英
    成功大學生科所
    學生
    黃祺真
    成功大學醫學院
    博士生
    林宜玫
    成功大學
    碩士生
    黃聖文
    成功大學
    學生
    林俊宏
    成功大學
    學生
    楊孔嘉
    成功大學
    副教授
    林咸嘉
    成功大學
    碩士生
    溫慧茹
    成功大學
    碩士生
    林建宏
    成功大學醫學院
    學生
    廖國勛
    生物資訊中心
    研究助理
    林雅琪
    成功大學
    研究助理
    趙詠梅
    成功大學
    碩士生
    林璧吟
    成功大學
    助理
    劉技謀
    成功大學
    博士生
    邱榮敬
    成功大學醫學院
    碩士生
    劉紋君
    成功大學
    學生
    柳錦燕
    國家衛生研究院
    研究助理
    潘郁仁
    成功大學
    學生
    徐中濟
    成功大學醫學院
    碩士生
    蔣輯武
    成功大學
    助理教授
    徐月梅
    成功大學醫學院
    學生
    蔡文暉
    成功大學
    學生
    高慶斌
    成功大學
    碩士生
    蔡秀真
    成功大學
    碩士生
    張永昇
    成功大學
    學生
    蕭述文
    成功大學
    學生
    張明玉
    成功大學
    研究助理
    賴文揚
    成功大學生化所
    碩士生
    莊佩錦
    成功大學醫學院
    博士生
    賴明德
    樹人醫護專
    助理教授
    莊治平
    成功大學
    碩士生
    賴毓貞
    成功大學
    碩士生
    莊偉哲
    成功大學
    副教授
    薛盈彰
    成功大學
    碩士生
    莊毓琪
    成功大學
    碩士生
    謝汶娟
    國家衛生研究院
    研究助理
    陳信壅
    成功大學醫工所
    碩士生
    簡佩珊
    成功大學
    碩士生
    陳威宇
    成功大學
    碩士生
    羅文聰
    成功大學
    碩士生
    陳建勳
    中山大學
    學生
    蘇重禎
    成功大學醫學院
    博士生
    陳春雨
    成功大學
    學生

     

    11/27 JEMBOSS 學員名單

    姓 名
    單  位
    職 稱
    姓 名
    單  位
    職 稱
    王文玲
    成功大學
    博士生
    陳曉燕
    成功大學
    學生
    王志宏
    成功大學醫學院
    博士生
    陳錦翠
    中山大學
    副教授
    王逸琳
    成功大學
    助理教授
    陳應輝
    成功大學醫學院
    碩士生
    石如茵
    熱帶園藝試驗所
    助理研究員
    陳麗琴
    成功大學
    博士生
    伍展弘
    成功大學
    學生
    曾大千
    成功大學
    助理教授
    江兆弘
    屏東科技大學
    研究助理
    曾雅詩
    成功大學醫學院
    博士生
    江倪全
    成功大學醫學院
    博士生
    曾鈺晶
    成功大學醫學院
    學生
    余秉弘
    台大醫學院
    博士生
    曾龍
    興國管理學院
    助理教授
    吳志偉
    成功大學
    學生
    程鈞煒
    成功大學
    研究助理
    吳秀梅
    成功大學醫學院
    研究助理
    黃士真
    成功大學醫學院
    學生
    呂淳雯
    成功大學
    學生
    黃詩云
    嘉義大學
    研究生
    李佩娟
    成功大學
    研究助理
    葉承昀
    成功大學醫學院
    研究生
    李英瑞
    成功大學
    學生
    葉靜華
    成功大學
    學生
    沈品均
    屏東科技大學
    研究助理
    詹湘漢
    成功大學
    研究助理
    辛致煒
    成功大學
    副教授
    劉宜芳
    成功大學醫學院
    學生
    林木源
    成功大學醫院
    醫師
    劉倩如
    成功大學醫學院
    學生
    林宏殷
    成功大學
    博士後研究
    劉家賓
    成功大學
    學生
    林宛瑩
    成功大學
    學生
    劉燕儒
    成功大學
    學生
    林欣怡
    成功大學醫學院
    學生
    蔣本慈
    成功大學
    博士後研究
    林姿君
    國家衛生研究院
    研究助理
    蔡文杰
    成功大學
    博士生
    林雅屏
    成功大學醫學院
    研究助理
    鄭佳欣
    成功大學
    碩士生
    林慧敏
    成功大學
    研究生
    鄭達恩
    成功大學醫學院
    研究生
    洪炎明
    嘉義大學
    副教授
    鄭獻文
    成功大學醫學院
    研究助理
    洪菁霞
    陽明大學
    學生
    蕭郁芸
    成功大學
    博士生
    徐千惠
    成功大學
    學生
    賴嬿羽
    成功大學醫學院
    研究助理
    張力云
    成功大學
    學生
    謝介平
    奇美醫院
    醫師
    張靖宏
    成功大學
    研究助理
    謝淑珠
    成功大學
    教授
    張翠砡
    成功大學醫學院
    講師
    韓煥文
    成功大學
    研究生
    張儷齡
    成功大學
    學生
    魏士欽
    義守大學
    研究生
    許仁宏
    屏東科技大學
    教授
    魏淑琴
    成功大學
    學生
    陳天文
    成功大學
    研究生
    羅仲邑
    成功大學
    研究助理
    陳必智
    成功大學醫學院
    碩士生
    羅雅勤
    成功大學
    研究生
    陳志堅
    嘉義榮民醫院
    主任
    蘇敬堯
    成功大學
    碩士生
    陳炳焜
    成功大學
    助理教授

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    Last updated 2003/11/18