!!AA_SCORING_MATRIX_RECT 1.0

BLOSUM90 amino acid substitution matrix.

                     February 20, 1996 14:55   ..

{
GAP_CREATE 12
GAP_EXTEND 6
}

      A    B    C    D    E     F    G    H    I    K     L    M    N    P    Q     R    S    T    V    W     X    Y    Z    * 
A     5   -2   -1   -3   -1    -3    0   -2   -2   -1    -2   -2   -2   -1   -1    -2    1    0   -1   -4    -1   -3   -1   -6 
B    -2    4   -4    4    0    -4   -2   -1   -5   -1    -5   -4    4   -3   -1    -2    0   -1   -4   -6    -2   -4    0   -6 
C    -1   -4    9   -5   -6    -3   -4   -5   -2   -4    -2   -2   -4   -4   -4    -5   -2   -2   -2   -4    -3   -4   -5   -6 
D    -3    4   -5    7    1    -5   -2   -2   -5   -1    -5   -4    1   -3   -1    -3   -1   -2   -5   -6    -2   -4    0   -6 
E    -1    0   -6    1    6    -5   -3   -1   -4    0    -4   -3   -1   -2    2    -1   -1   -1   -3   -5    -2   -4    4   -6 

F    -3   -4   -3   -5   -5     7   -5   -2   -1   -4     0   -1   -4   -4   -4    -4   -3   -3   -2    0    -2    3   -4   -6 
G     0   -2   -4   -2   -3    -5    6   -3   -5   -2    -5   -4   -1   -3   -3    -3   -1   -3   -5   -4    -2   -5   -3   -6 
H    -2   -1   -5   -2   -1    -2   -3    8   -4   -1    -4   -3    0   -3    1     0   -2   -2   -4   -3    -2    1    0   -6 
I    -2   -5   -2   -5   -4    -1   -5   -4    5   -4     1    1   -4   -4   -4    -4   -3   -1    3   -4    -2   -2   -4   -6 
K    -1   -1   -4   -1    0    -4   -2   -1   -4    6    -3   -2    0   -2    1     2   -1   -1   -3   -5    -1   -3    1   -6 

L    -2   -5   -2   -5   -4     0   -5   -4    1   -3     5    2   -4   -4   -3    -3   -3   -2    0   -3    -2   -2   -4   -6 
M    -2   -4   -2   -4   -3    -1   -4   -3    1   -2     2    7   -3   -3    0    -2   -2   -1    0   -2    -1   -2   -2   -6 
N    -2    4   -4    1   -1    -4   -1    0   -4    0    -4   -3    7   -3    0    -1    0    0   -4   -5    -2   -3   -1   -6 
P    -1   -3   -4   -3   -2    -4   -3   -3   -4   -2    -4   -3   -3    8   -2    -3   -2   -2   -3   -5    -2   -4   -2   -6 
Q    -1   -1   -4   -1    2    -4   -3    1   -4    1    -3    0    0   -2    7     1   -1   -1   -3   -3    -1   -3    4   -6 

R    -2   -2   -5   -3   -1    -4   -3    0   -4    2    -3   -2   -1   -3    1     6   -1   -2   -3   -4    -2   -3    0   -6 
S     1    0   -2   -1   -1    -3   -1   -2   -3   -1    -3   -2    0   -2   -1    -1    5    1   -2   -4    -1   -3   -1   -6 
T     0   -1   -2   -2   -1    -3   -3   -2   -1   -1    -2   -1    0   -2   -1    -2    1    6   -1   -4    -1   -2   -1   -6 
V    -1   -4   -2   -5   -3    -2   -5   -4    3   -3     0    0   -4   -3   -3    -3   -2   -1    5   -3    -2   -3   -3   -6 
W    -4   -6   -4   -6   -5     0   -4   -3   -4   -5    -3   -2   -5   -5   -3    -4   -4   -4   -3   11    -3    2   -4   -6 

X    -1   -2   -3   -2   -2    -2   -2   -2   -2   -1    -2   -1   -2   -2   -1    -2   -1   -1   -2   -3    -2   -2   -1   -6 
Y    -3   -4   -4   -4   -4     3   -5    1   -2   -3    -2   -2   -3   -4   -3    -3   -3   -2   -3    2    -2    8   -3   -6 
Z    -1    0   -5    0    4    -4   -3    0   -4    1    -4   -2   -1   -2    4     0   -1   -1   -3   -4    -1   -3    4   -6 
*    -6   -6   -6   -6   -6    -6   -6   -6   -6   -6    -6   -6   -6   -6   -6    -6   -6   -6   -6   -6    -6   -6   -6    1