!!AA_SCORING_MATRIX_RECT 1.0

BLOSUM80 amino acid substitution matrix.

                     February 20, 1996 14:55   ..

{
GAP_CREATE 17
GAP_EXTEND 8
}

      A    B    C    D    E     F    G    H    I    K     L    M    N    P    Q     R    S    T    V    W     X    Y    Z    * 
A     7   -3   -1   -3   -2    -4    0   -3   -3   -1    -3   -2   -3   -1   -2    -3    2    0   -1   -5    -1   -4   -2   -8 
B    -3    6   -6    6    1    -6   -2   -1   -6   -1    -7   -5    5   -4   -1    -2    0   -1   -6   -8    -3   -5    0   -8 
C    -1   -6   13   -7   -7    -4   -6   -7   -2   -6    -3   -3   -5   -6   -5    -6   -2   -2   -2   -5    -4   -5   -7   -8 
D    -3    6   -7   10    2    -6   -3   -2   -7   -2    -7   -6    2   -3   -1    -3   -1   -2   -6   -8    -3   -6    1   -8 
E    -2    1   -7    2    8    -6   -4    0   -6    1    -6   -4   -1   -2    3    -1   -1   -2   -4   -6    -2   -5    6   -8 

F    -4   -6   -4   -6   -6    10   -6   -2   -1   -5     0    0   -6   -6   -5    -5   -4   -4   -2    0    -3    4   -6   -8 
G     0   -2   -6   -3   -4    -6    9   -4   -7   -3    -7   -5   -1   -5   -4    -4   -1   -3   -6   -6    -3   -6   -4   -8 
H    -3   -1   -7   -2    0    -2   -4   12   -6   -1    -5   -4    1   -4    1     0   -2   -3   -5   -4    -2    3    0   -8 
I    -3   -6   -2   -7   -6    -1   -7   -6    7   -5     2    2   -6   -5   -5    -5   -4   -2    4   -5    -2   -3   -6   -8 
K    -1   -1   -6   -2    1    -5   -3   -1   -5    8    -4   -3    0   -2    2     3   -1   -1   -4   -6    -2   -4    1   -8 

L    -3   -7   -3   -7   -6     0   -7   -5    2   -4     6    3   -6   -5   -4    -4   -4   -3    1   -4    -2   -2   -5   -8 
M    -2   -5   -3   -6   -4     0   -5   -4    2   -3     3    9   -4   -4   -1    -3   -3   -1    1   -3    -2   -3   -3   -8 
N    -3    5   -5    2   -1    -6   -1    1   -6    0    -6   -4    9   -4    0    -1    1    0   -5   -7    -2   -4   -1   -8 
P    -1   -4   -6   -3   -2    -6   -5   -4   -5   -2    -5   -4   -4   12   -3    -3   -2   -3   -4   -7    -3   -6   -2   -8 
Q    -2   -1   -5   -1    3    -5   -4    1   -5    2    -4   -1    0   -3    9     1   -1   -1   -4   -4    -2   -3    5   -8 

R    -3   -2   -6   -3   -1    -5   -4    0   -5    3    -4   -3   -1   -3    1     9   -2   -2   -4   -5    -2   -4    0   -8 
S     2    0   -2   -1   -1    -4   -1   -2   -4   -1    -4   -3    1   -2   -1    -2    7    2   -3   -6    -1   -3   -1   -8 
T     0   -1   -2   -2   -2    -4   -3   -3   -2   -1    -3   -1    0   -3   -1    -2    2    8    0   -5    -1   -3   -2   -8 
V    -1   -6   -2   -6   -4    -2   -6   -5    4   -4     1    1   -5   -4   -4    -4   -3    0    7   -5    -2   -3   -4   -8 
W    -5   -8   -5   -8   -6     0   -6   -4   -5   -6    -4   -3   -7   -7   -4    -5   -6   -5   -5   16    -5    3   -5   -8 

X    -1   -3   -4   -3   -2    -3   -3   -2   -2   -2    -2   -2   -2   -3   -2    -2   -1   -1   -2   -5    -2   -3   -1   -8 
Y    -4   -5   -5   -6   -5     4   -6    3   -3   -4    -2   -3   -4   -6   -3    -4   -3   -3   -3    3    -3   11   -4   -8 
Z    -2    0   -7    1    6    -6   -4    0   -6    1    -5   -3   -1   -2    5     0   -1   -2   -4   -5    -1   -4    6   -8 
*    -8   -8   -8   -8   -8    -8   -8   -8   -8   -8    -8   -8   -8   -8   -8    -8   -8   -8   -8   -8    -8   -8   -8    1 
