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GCG常問問題 -> Data Serve |
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巨 分 子 序 列 分 析 服 務 |
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即 日 起 本 院 GCG 主 機 將 每 日 更 新 GenBank 序 列 資 料 庫 , 使 用 者 將 可 查 詢 比 對 最 新 的 DNA 序 列 資 料 。 |
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本 院 GCG 主 機 已 完 成 加 裝 DataServe 系 統 , 本 系 統 將 自 動 於 每 天 午 夜 十 二 點 自 動 將 最 新 的 NCBI GenBank 序 列 資 料 加 入 GCG 主 機 , 扣 除 資 料 傳 輸 及 格 式 轉 換 所 需 時 間 , 日 後 使 用 者 在 本 院 GCG 主 機 中 找 到 的 GenBank 序 列 資 料 將 與 美 國 NCBI 僅 有 二 至 三 天 的 時 間 差 。
也 就 是 說 , 如 果 您 在 08-JUN-1999 使 用 GCG Command Mode 及 SeqWeb 以 FastA, BLAST, StringSearch, LookUp 等 方 式 搜 尋 或 比 對 GenBank DNA 序 列 資 料 庫 , 您 將 可 以 找 到 Submission Date 05-JUN-1999 之 前 的 所 有 GenBank 資 料 。 |
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各 程 式 使 用 新 舊 資 料 庫 方 式 如 下 : |
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其 中 舊 資 料 庫 指 每 兩 個 月 更 新 一 次 的 GenBank 資 料 , 新 資 料 庫 指 的 是 自 每 兩 個 月 的 Major Update 至 今 的 新 增 序 列 資 料 。 |
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Program |
Old Database |
New Database |
Old + New Database |
StringSearch |
gb_in:*
(for example) |
gb_in_new:*
(for example) |
GenEmbl:*
GenBank:* |
LookUp |
e)genbank
h)gb_tags |
f)genbanknew
i)gb_tagsnew |
j)All libraries |
FastA |
gb_in:*
(for example) |
gb_in_new:*
(for example) |
GenEmbl:*
GenBank:* |
BLAST |
1)genembl
2)est
3)gss |
4)genbanknew
5)gb_tagsnew |
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註 : 以 SeqWeb 使 用 FastA 及 StringSearch , 所 選 之 各 DNA 資 料 庫 皆 為 新 舊 合 併 (如 nucleic acid : invertebrate 等 於 gb_in:* 加 gb_in_new:*) |
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