回首頁
站內搜尋
EMBOSS
PDA
Discussion group
Site Map
TBI Core
 
 

EMBOSS
EMBOSS服務說明
  1. EMBOSS 簡介
    EMBOSS 全名為 "The European Molecular Biology Open Software Suite",(原站位於http://emboss.sourceforge.net/),為免費的開源軟體套組,目前本網站提供的是EMBOSS GUI,這是由 Luke McCarthy (Plant Biotechnology Institute, National Research Council of Canada, 所開發出來的網路介面,將常用的EMBOSS程式經過整理分類,撰寫成簡潔的網路介面,提供使用者以網路瀏覽器執行 EMBOSS程式,且使用GUI不需要帳號密碼,十分簡便。不過,EMBOSS GUI沒有檔案管理功能,我們提供的EMBOSS GUI程式是安裝在GALAXY 中的workflow,同樣沒有檔案儲存管理功能,因此,每次的分析結果請務必立刻存到自己的主機中。
    要特別說明的是,有些EMBOSS GUI程式已無法使用,以下是本網站測試後發現無法使用的程式,使用前請務必先確認。

    經過測試無法使用的EMBOSS程式

    coderet

    prettyseq

    cai custom

    patmatdb

    fuzznuc

    pepnet

    btwisted

    dottup

    newseq

    twofeat

    vectorstrip

    oddcomp

    tcode

    compseq

    maskfeat

    seqmatchall

    skipseq

    iep

    textsearch

    preg

    extractfeat

    epestfind

    pepwindowall

    lindna

    prettyplot

    nthseq


  2. 正確引用EMBOSS
    使用EMBOSS程式發表論文,須引用程式來源,如下:

    EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite (2000)
    Rice,P. Longden,I. and Bleasby,A.
    Trends in Genetics 16, (6) pp276-277

  3. EMBOSS程式說明
    在EMBOSS原站(http://emboss.sourceforge.net/docs/)提供EMBOSS程式介紹以及使用說明(http://emboss.sourceforge.net/docs/emboss_tutorial/emboss_tutorial.html),可以查閱參考。

  4. EMBOSS程式操作示範

    使用EMBOSS workflow不需要申請帳號,請參考影音說明:

      竹南院區/苗栗縣竹南鎮 350 科研路 35 號  

      Copyright © National Health Research Institutes. All rights reserved.