EMBOSS 全名為 "The European Molecular Biology Open Software Suite"，(原站位於http://emboss.sourceforge.net/)，為免費的開源軟體套組，目前本網站提供的是EMBOSS GUI，這是由 Luke McCarthy (Plant Biotechnology Institute, National Research Council of Canada, 所開發出來的網路介面，將常用的EMBOSS程式經過整理分類，撰寫成簡潔的網路介面，提供使用者以網路瀏覽器執行 EMBOSS程式，且使用GUI不需要帳號密碼，十分簡便。不過，EMBOSS GUI沒有檔案管理功能，我們提供的EMBOSS GUI程式是安裝在GALAXY 中的workflow，同樣沒有檔案儲存管理功能，因此，每次的分析結果請務必立刻存到自己的主機中。
要特別說明的是，有些EMBOSS GUI程式已無法使用，以下是本網站測試後發現無法使用的程式，使用前請務必先確認。
經過測試無法使用的EMBOSS程式
coderet
prettyseq
cai custom
patmatdb
fuzznuc
pepnet
btwisted
dottup
newseq
twofeat
vectorstrip
oddcomp
tcode
compseq
maskfeat
seqmatchall
skipseq
iep
textsearch
preg
extractfeat
epestfind
pepwindowall
lindna
prettyplot
nthseq
正確引用EMBOSS
使用EMBOSS程式發表論文，須引用程式來源，如下：
EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite
(2000)
Rice,P. Longden,I. and Bleasby,A.
Trends in Genetics 16, (6) pp276-277
EMBOSS on Galaxy Docker介紹 (video)